داده های خام اخذ شده در fNIRS دارای نویزهای فیزیولوژیک و غیر فیزولوژیک می باشند که جهت استخراج ویژگی های مد نظر باید تا حد امکان این نویز ها را برطرف کرد و سپس نسبت به استخراج ویژگی اقدام کرد.
در آزمایشگاه ملی نقشه برداری مغز این مراحل توسط تولباکس های Homer3,NIRS_Kit,OXYsoft و نرم افزار MATLAB انجام میگیرد.
