در بخش های مختلفی از پردازش تصاویر fMRI، نیاز به تبدیل مکانی تصاویر وجود دارد. برای مثال، برای آنکه تصاویر گرفته شده از یک سوژه را بر یکدیگر منطبق کنیم (حذف حرکت سر انجام دهیم) و یا برای آنکه تصاویر سوژه های مختلف را بر هم منطبق کنیم (تا امکان آنالیز گروهی فراهم شود)، از تبدیل مکانی استفاده می کنیم.
