کارگاه ۴ روزه‌ی آنالیز دیتای fMRI با استفاده از FreeSurfer و Matlab ٬ در تاریخ ۴ تا ۷ مهر ۱۳۹۶ برگزار گردید

در حاشیه‌ی اولین سمپوزیوم تازه‌های نقشه برداری مغز ایران٬ کارگاه ۴ روزه‌ی آنالیز دیتای fMRI با استفاده از FreeSurfer و Matlab ٬ در تاریخ ۴ تا ۷ مهر ۱۳۹۶ در آزمایشگاه ملی نقشه‌برداری مغز برگزار گردید.

مدرسین:

• دکتر رضا راجی مهر (دانشگاه MIT)
• دکتر حامد نیلی (دانشگاه اکسفورد)
• دکتر شاهین نصر (بیمارستان جنرال ماساچوست)
• دکتر روح الله عبداللهی (Forschungszentrum Jülich)
• دکتر الهه یارقلی (دانشگاه تهران)
• لادن شهشهانی (IPM)
• آرمین مداح (IPM)

سرفصل‌هایی که در این کارگاه تدریس شد عبارتند از:

روز اول

• Introduction to the workshop – Dr. Reza Rajimehr
• Tour of National Brain Mapping Lab – Dr. Hossein-Zadeh and NBML team
• A brief tutorial on Linux (optional) – Dr. Reza Rajimehr and Armin Maddah
• Structural MRI analysis and cortical surface reconstruction in Freesurfer – Dr. Reza Rajimehr
• Visualization of anatomical volumes and surfaces in Freesurfer – Dr. Reza Rajimehr and Dr. Elahe’ Yargholi

روز دوم

• Basics of fMRI analysis – Dr. Reza Rajimehr
• Preprocessing of fMRI data in FsFast – Dr. Reza Rajimehr and Dr. Elahe’ Yargholi
• Functional-anatomical registration – Dr. Reza Rajimehr
• Single-subject analysis of fMRI data in FsFast – Dr. Reza Rajimehr and Dr. Elahe’ Yargholi
• Visualization of functional maps – Dr. Reza Rajimehr and Dr. Elahe’ Yargholi

روز سوم

• Group-level analysis of fMRI data in FsFast – Dr. Elahe’ Yargholi
• Region-of-interest analysis – Dr. Reza Rajimehr
• Transfer of structural and functional data between Freesurfer and Matlab – Dr. Reza Rajimehr
• Functional connectivity and network analysis - Ladan Shahshahani
• Retinotopic mapping – Dr. Rouhollah Abdollahi

روز چهارم

• Multi-voxel pattern analysis – Dr. Hamed Nili
• Representational similarity analysis – Dr. Hamed Nili
• Advanced topics and statistical issues in fMRI data analysis – Dr. Hamed Nili
• High-resolution fMRI – Dr. Shahin Nasr
• Conclusion of the workshop – Dr. Reza Rajimehr