همانند سایر سیستم های تصویر برداری، نویز در سیگنال تداخل ایجاد می کند و اگر SNR ، از حدی پایین-تر شود، اطلاعات مورد نظر را نمی توان از تصویر تشخیص داد.
با توجه به مطالعات قبلی و ترکیب fNIRS با دیگر مدالیته ها مانند rTMS و ECT و همچنین روش های تحریک الکتریکی و روش های رفتار درمانی شناختی، میتوان از این تکنیک در درمان نیز استفاده کرد.
استفاده از fNIRS در اختلالاتی همانند افسردگی و اختلال دو قطبی نیز در مطالعات وارد شده است.همانند مطالعات بر روی اسکیزوفرنی Okada و همکارانش در سال 1996 در این اختلالات نیز از تسک mirror drawing task (MDT) برای بررسی دو نیمکره سر استفاده کردند.
در مطالعه ی دیگری توسط Suto و همکارانش، باfNIRS و استفاده از تکلیف VFT جهت نشان دادن تغییرات اکسی هموگلوبین در فرونتال، داده های افراد اسکیزوفرنی با افراد افسرده مقایسه شد.
مشابه مطالعات قبلی Fallgatter and Strik در سال 2000 ارتباط بین الگوی فعالیت دو سمت (چپ و راست) در فرونتال را در طول انجام یک تست عملکردی مستمر، بررسی کردند.