اندازه گیری پتانسیل های زیستی ساده نیست، زیرا الکترودها خودشان مقاومت و ظرفیت قابل توجهی را تشکیل می دهند (شکل 1)، معمولا به عنوان امپدانس الکترود نشان داده شده است.
هدف از ست آپ اندازه گیری این است که تا حد امکان سیگنال های بیولوژیکی را تمیز (با حداقل نویز ممکن) اندازه گیری کند، بدون اینکه تعاملات قابل توجهی با وسیله اندازه گیری داشته باشد.
ضبط مناسب داده برای پردازش سیگنال امری ضروری است. در هر ست آپ ضبط، دستگاه های متصل شده بهم و متصل شده به فرایند بیولوژیکی یک مجموعه ای را به نام زنجیره اندازه گیری تشکیل می دهند.
پس از شناساندن ابعاد سر فرد به دستگاه یا در اصطلاح Registration فرد می‌توانیم کویل را روی سر فرد نمایش دهیم و نقاط مربوط به تحریک مغناطیسی و هدف را روی سر فرد نشان دهیم.
